Tugas pokok dan fungsi Pengadilan Agama adalah sebagaimana diatur dalam Pasal 49 Undang-Undang Nomor 7 Tahun 1989, yang telah diubah dengan Undang-Undang Nomor 3 Tahun 2006, yaitu bahwa Pengadilan Agama bertugas dan berwenang memeriksa, memutus dan menyelesaikan perkara ditingkat pertama antara orang-orang yang beragama Islam di bidang :

1. Perkawinan
2. Waris
3. Wasiat
4. Hibah
5. Wakaf
6. Zakat
7. Infaq
8. Shadaqah
9. Ekonomi Syari’ah

Selain itu juga Pengadilan Agama dapat memberikan Isbat Kesaksian Rukyah Hilal dalam penentuan awal bulan pada tahun Hijriyah.